填补黄河、长江流域要津时期遗传史空缺，复旦团队最新分子考古遵守为交融东亚农业东谈主群推广机制提供了新视角。

农业的出现符号着东谈主类从狩猎采集迈向假寓援手，潜入变革了东谈主类的生计样貌、东谈主口结构、健康景色、遗传安妥及文化面庞。这场农业翻新在西亚、东亚和好意思洲等多地独处发源后，慢慢向周边区域扩散。天然考古谈论已初步勾画出农业传播的时刻、地舆节点与旅途，但其背后的复杂扩散机制，尤其是“东谈主口扩散”与“文化扩散”的学术争论，一经学术界的焦点。

中国的黄河与长江流域四肢宇宙上最陈旧的独处的农业发源中心之一，别离驯化了粟黍和水稻，生长了早期中中斯文，更是鼓吹了史前农作物的寰球化传播。但是，由于古代东谈主类基因组数据的匮乏（尤其是长江流域），这两大流域东谈主群的遗传历史谈论恒久存在空缺。

近日，复旦大学分子考古实际室文少卿团队、生命科学学院金力院士和王传超团队、南京师范大学贾鑫团队调处甘肃省文物考古谈论所、陕西省考古谈论院、郑州大学、上海天然博物馆（上海科技馆分馆）、重庆市文物考古谈论院、重庆中国三峡博物馆、中国科学工夫大学、兰州大学、太原市文物保护谈论院、西北大学、榆林市文物考古勘察使命队、山西省考古谈论院、西北工业大学、华东师范大学和郑州市文物考古谈论院等单元，在Cell Genomics发表了题为“The genomic history of East Asian Middle Neolithic millet- and rice-agricultural populations”的热切谈论论文。

该谈论汇集了20处考古古迹（距今6231-4650年前）的74例样本。在黄河流域，该谈论提真金不怕火和测序了上游仰韶文化和马家窑文化的21个古基因组（甘肃省的圪垯川古迹、王家阴洼古迹、地面湾古迹和山那树扎古迹），中游仰韶文化的43个古基因组（山西省的辕村古迹和镇城古迹；陕西省的吴中古迹、南寨子古迹、东营古迹、杨官寨古迹、灰坡岭古迹、马腾空古迹和王阳畔古迹）以及下贱大汶口文化的3个古基因组（江苏省的刘林古迹，后与本实际室之前发表的黄河下贱大汶口文化DNA数据连系并）。在长江流域，该谈论提真金不怕火和测序了中游大溪文化的4个古基因组（重庆市的大溪古迹）和下贱崧泽文化和良渚文化的3个古基因组（上海市的福泉山古迹和马桥古迹）。该谈论发布了迄今为止最大鸿沟的东亚新石器时期中期的古基因组数据集，涵盖了东亚两大农业发源中心，为深入沟通东亚农业东谈主群扩散机制提供了要津遗传学凭证。

图1 A 样本时空散播图；图1B 主要素分析图

新石器时期中期，粟黍农业与东谈主群的共扩散

在新石器时期中期，以黄河中游东谈主群为中枢，粟黍农业东谈主群呈现大鸿沟辐照状扩散。

东谈主群向北扩展至河套地区、向东北扩展至西辽河流域、向南扩展至长江中下贱地区、向西扩展至青藏高原东北部、向东扩展至黄河下贱地区。

这一遗传扩散形状与庙底沟文化的推广和粟作农业的发展高度吻合。

谈论同期揭示，在与周边文化东谈主群的互动经由中，黄河流域不同区域的东谈主群酿成了特有的遗传结构。沿渭河流域散播的仰韶文化东谈主群与青藏高原东谈主群具有较近的遗传亲缘联系，这些个体具有8.3%~55%高原关联的祖宗要素；位于陕西东部、晋西南和河南中西部的大部分东谈主群遗传结构相对单一，主要着手于黄河中游关联的祖宗要素；而黄河下贱东谈主群则主要受到当地狩猎采集东谈主群以及南边东谈主群的影响，具有7.1%~57.3%中国南边陲联的祖宗要素。

谈论标明，文化因素和地舆因素共同塑造了黄河流域东谈主群遗传亚结构的酿成，而地舆因素在其中起到了要津性的作用。

图2 qpadm模拟图

黄河流域与长江流域存在双向的东谈主群互动

沿海地区一直被觉得是南朔方相易的热切区域，悛改石器时期早期以来就存在着东谈主群之间的相易互动。此前的谈论觉得，黄河流域的南边要素主要源自东南沿海地区。但该谈论通过分析长江中下贱新石器时期中期的基因组数据，发现黄河流域东谈主群所具有的南边要素更可能是源于周边的长江流域而不是东南沿海地区。

值得留神的是，南朔方东谈主群的相易并不局限于东部沿海地区，在南阳盆地的朱岗古迹也检测到14.7%的南边祖宗要素。

此外，早在新石器时期中期，黄河流域关联的祖宗要素就扩展到长江流域，在长江中下贱东谈主群的基因组中均检测到黄河流域关联的祖宗要素。这些限度齐标明，黄河流域和长江流域早在新石器时期中期就存在双向的东谈主群互动。

高原东谈主群与黄河上游东谈主群之间存在密切的遗传估计和相易互动

青藏高原被誉为“宇宙第三极”，对于青藏高原东谈主群的酿成经由一直是学术界的中枢问题之一，主流假说觉得其主要遗传要素源于中国朔方农业东谈主群。但由于假定着手区古基因组数据的不及，该假说无法取得进一步考证。

该谈论发现，与中国朔方其他地区东谈主群比拟，高原东谈主群与黄河上游农业东谈主群之间的遗传估计最为密切。关联性分析标明，与高原东谈主群的遗传估计与经度呈显赫的关联联系，而与纬度无显著的关联性。qpadm分析流露黄河上游东谈主群领有19.5%-55%的高原祖宗要素，尤其是圪垯川古迹和地面湾古迹齐有高原要素跳跃50%的个体。

尽头值得留神的是，谈论团队在黄河上游的地面湾古迹中，发现了一例迄今为止最早的（5819 cal BP），具有青藏高原东谈主群特有EPAS1单倍型的当代东谈主，这亦然黄河流域唯独的一例具有青藏高原特有EPAS1单倍型的个体。这些发现齐标明，早在距今5800年左右，高原东谈主群与黄河上游东谈主群之间存在着密切的遗传估计和相易互动。

图3 f4统计与经度/纬度的关联性分析，f4值越小代表与测试群体遗传估计越淡雅

台湾南岛语东谈主群遗传发源可讲究至长江流域

对于南岛语东谈主群的发源和扩散，前期通过对福建和台湾省古东谈主和当代东谈主群的DNA谈论，发现不管台湾古代东谈主群如故当代台湾南岛语族与大陆华南地区壮侗语东谈主群和福建古代东谈主群共有的等位基因远超其他东亚东谈主群，标明南岛语族和壮侗语东谈主群遗传同源，南岛语族可能径直发源于中国东南沿海。然则也有谈论者根据南岛语东谈主群Y染色体类型的地舆散播提倡猜思，南岛语族可能有更朔方的发源，致使可讲究至新石器时期的长江流域农业东谈主群，由于长江流域基因组数据的清寒，该假说无法取得进一步的考证。

谈论团队通过对长江流域新石器时期中期的古东谈主基因组数据的分析，发现当代的台湾南岛语东谈主群与长江流域农业东谈主群的遗传亲缘性高于与新石器时期晚期之前的中国东南沿海东谈主群的亲缘性，况且这些东谈主群的遗传要素主要来自于长江流域农业东谈主群，这些发现阐述了南岛语族祖宗可进一步讲究至新石器时期长江流域农业东谈主群，突显了长江流域东谈主群迁移在南岛语族酿成和扩散中的作用。

这项谈论通过构建和分析迄今最大鸿沟的东亚新石器时期古基因组数据集，为交融新石器时期中期农业推广奈何潜入塑造东亚东谈主群的遗传历史提供了热切的新视角。它填补了黄河、长江流域要津时期的遗传史空缺，治理了对于东亚农业东谈主群扩散机制、高原东谈主群酿成及南岛语族发源的恒久学术争议。

复旦大学科技考古谈论院博士后熊建雪、厦门大学生命科学学院博士生徐煜、甘肃省文物考古谈论所谈论员陈国科、陕西省考古谈论院副谈论员杨利平、郑州大学考古与文化遗产学院施展周亚威为该论文的共同第一作家。南京师范大学环境考古谈论院贾鑫施展、复旦大学生命科学学院金力院士、复旦大学当代东谈主类学素质部要点实际室/厦门大学东谈主类学谈论所王传超施展、复旦大学科技考古谈论院的文少卿副施展为共同通信作家。